Name c3mLDmx5czvnShfckohDCDFpABFKDmABFKDm7DvaDmABFKDmRrCowm_0
Workunit 1960170
Created 12 Dec 2019, 12:50:05 UTC
Sent 12 Dec 2019, 13:52:22 UTC
Report deadline 19 Dec 2019, 13:52:22 UTC
Received 12 Dec 2019, 15:39:17 UTC
Server state Over
Outcome Success
Client state Done
Exit status 0 (0x00000000)
Computer ID 3723
Run time 57 min 5 sec
CPU time 1 hours 8 min 14 sec
Validate state Valid
Credit 47.26
Device peak FLOPS 5.96 GFLOPS
Application version ATLAS Simulation v0.92 (native_mt)
x86_64-pc-linux-gnu
Peak working set size 1.79 GB
Peak swap size 2.55 GB
Peak disk usage 719.63 MB

Stderr output

<core_client_version>7.5.1</core_client_version>
<![CDATA[
<stderr_txt>
15:41:01 (32753): wrapper (7.7.26015): starting
15:41:01 (32753): wrapper: running run_atlas (--nthreads 2)
Do 12. Dez 15:41:01 CET 2019: Using singularity image /cvmfs/atlas.cern.ch/repo/containers/images/singularity/x86_64-centos7.img
Do 12. Dez 15:41:01 CET 2019: Arguments: --nthreads 2
Do 12. Dez 15:41:01 CET 2019: Threads: 2
Do 12. Dez 15:41:01 CET 2019: Checking for CVMFS
Do 12. Dez 15:41:09 CET 2019: Probing /cvmfs/atlas.cern.ch... OK
Do 12. Dez 15:41:11 CET 2019: Probing /cvmfs/atlas-condb.cern.ch... OK
Do 12. Dez 15:41:14 CET 2019: Probing /cvmfs/grid.cern.ch... OK
Do 12. Dez 15:41:14 CET 2019: Probing /cvmfs/cernvm-prod.cern.ch... OK
Do 12. Dez 15:41:14 CET 2019: Probing /cvmfs/sft.cern.ch... OK
Do 12. Dez 15:41:15 CET 2019: Probing /cvmfs/alice.cern.ch... OK
Do 12. Dez 15:41:16 CET 2019: VERSION PID UPTIME(M) MEM(K) REVISION EXPIRES(M) NOCATALOGS CACHEUSE(K) CACHEMAX(K) NOFDUSE NOFDMAX NOIOERR NOOPEN HITRATE(%) RX(K) SPEED(K/S) HOST PROXY ONLINE
Do 12. Dez 15:41:16 CET 2019: 2.7.0.0 476 0 22592 57872 3 1 2813448 4194305 0 65024 0 0 n/a 20277 2675 http://s1cern-cvmfs.openhtc.io/cvmfs/atlas.cern.ch DIRECT 1
Do 12. Dez 15:41:16 CET 2019: CVMFS is ok
Do 12. Dez 15:41:16 CET 2019: Checking for singularity binary...
Do 12. Dez 15:41:16 CET 2019: which: no singularity in (/usr/local/bin:/usr/local/sbin:/usr/bin:/usr/sbin:/bin:/sbin:/root/bin)
Do 12. Dez 15:41:16 CET 2019: Singularity is not installed, using version from CVMFS
Do 12. Dez 15:41:16 CET 2019: Checking singularity works with /cvmfs/atlas.cern.ch/repo/containers/sw/singularity/x86_64-el7/current/bin/singularity exec -B /cvmfs /cvmfs/atlas.cern.ch/repo/containers/images/singularity/x86_64-centos7.img hostname
Do 12. Dez 15:41:51 CET 2019: INFO:  Convert SIF file to sandbox... RYZSL76 INFO:  Cleaning up image...
Do 12. Dez 15:41:51 CET 2019: Singularity works
Do 12. Dez 15:41:55 CET 2019: Set ATHENA_PROC_NUMBER=2
Do 12. Dez 15:41:55 CET 2019: Starting ATLAS job with PandaID=4002876565
Do 12. Dez 15:41:55 CET 2019: Running command: /cvmfs/atlas.cern.ch/repo/containers/sw/singularity/x86_64-el7/current/bin/singularity exec --pwd /root/Downloads/BOINC/slots/1 -B /cvmfs,/root /cvmfs/atlas.cern.ch/repo/containers/images/singularity/x86_64-centos7.img sh start_atlas.sh
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:  *** The last 200 lines of the pilot log: ***
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:             "avgPSS": 299895, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:             "avgRSS": 329421, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:             "avgSwap": 0, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:             "avgVMEM": 1109158, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:             "rateRBYTES": 3272888, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:             "rateRCHAR": 797417, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:             "rateWBYTES": 23249, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:             "rateWCHAR": 30057
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:           }, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:           "Max": {
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:             "maxPSS": 642770, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:             "maxRSS": 718568, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:             "maxSwap": 0, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:             "maxVMEM": 2284124, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:             "totRBYTES": 1374613504, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:             "totRCHAR": 334915362, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:             "totWBYTES": 9764864, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:             "totWCHAR": 12624513
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:           }
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:         }, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:         "postExe": {
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:           "cpuTime": 3, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:           "wallTime": 1
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:         }, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:         "preExe": {
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:           "cpuTime": 9, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:           "wallTime": 30
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:         }, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:         "total": {
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:           "cpuTime": 209, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:           "wallTime": 448
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:         }, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:         "validation": {
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:           "cpuTime": 0, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:           "wallTime": 0
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:         }, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:         "wallTime": 417
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:       }
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:     }, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:     "machine": {
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:       "cpu_family": "23", 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:       "linux_distribution": [
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:         "CentOS Linux", 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:         "7.6.1810", 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:         "Core"
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:       ], 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:       "model": "8", 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:       "model_name": "AMD Ryzen 7 2700 Eight-Core Processor", 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:       "node": "RYZSL76", 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:       "platform": "Linux-3.10.0-1062.7.1.el7.x86_64-x86_64-with-centos-7.6.1810-Core"
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:     }, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:     "transform": {
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:       "cpuEfficiency": 0.6579, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:       "cpuPWEfficiency": 0.6936, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:       "cpuTime": 24, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:       "cpuTimeTotal": 4280, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:       "externalCpuTime": 47, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:       "processedEvents": 10, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:       "trfPredata": null, 
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:       "wallTime": 3078
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:     }
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019:   }
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: }
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,757 | DEBUG    | queue_monitor       | pilot.util.auxiliary.4002876565  | update_server             | xml:will send fileinfo
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,757 | INFO     | queue_monitor       | pilot.control.job.4002876565     | send_state                | pilot will not update the server (heartbeat message will be written to file)
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,757 | INFO     | queue_monitor       | pilot.control.job.4002876565     | send_state                | job 4002876565 has finished - writing final server update
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,757 | DEBUG    | queue_monitor       | pilot.control.job.4002876565     | get_data_structure        | building data structure to be sent to server with heartbeat
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,763 | INFO     | queue_monitor       | pilot.util.auxiliary.4002876565  | get_job_metrics           | will not add max space = -351038029 B to job metrics
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,774 | DEBUG    | queue_monitor       | pilot.api.analytics              | get_fitted_data           | removing tails from data to be fitted
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,774 | INFO     | queue_monitor       | pilot.api.analytics              | get_fitted_data           | fitting pss+swap vs Time
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,775 | INFO     | queue_monitor       | pilot.api.analytics              | get_fitted_data           | current memory leak: -185.93 B/s (using 45 data points, chi2=11345868)
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,775 | DEBUG    | queue_monitor       | pilot.util.auxiliary.4002876565  | get_job_metrics           | job metrics="coreCount=2 actualCoreCount=1 nEvents=10 leak=-185.93 chi2=11345868"
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,775 | INFO     | queue_monitor       | pilot.control.job.4002876565     | get_data_structure        | total number of processed events: 10 (read)
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,776 | INFO     | queue_monitor       | pilot.user.atlas.utilities       | get_memory_values         | using path: /root/Downloads/BOINC/slots/1/PanDA_Pilot-4002876565/memory_monitor_summary.json (trf name=prmon)
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,778 | DEBUG    | queue_monitor       | pilot.user.atlas.utilities       | get_memory_monitor_info   | summary_dictionary={'Max': {'rx_packets': 29316, 'nprocs': 8, 'nthreads': 1, 'rx_bytes': 33648911, 'wtime': 3151, 'rss': 5653548, 'write_bytes': 25460736, 'vmem': 8672228, 'read_bytes': 3534934016, 'stime': 347, 'tx_bytes': 1642320, 'pss': 2208154, 'wchar': 31215077, 'rchar': 1135707700, 'tx_packets': 7089, 'swap': 0, 'utime': 3806}, 'Avg': {'write_bytes': 8078, 'nprocs': 6, 'nthreads': 0, 'rx_bytes': 10676, 'rx_packets': 9, 'vmem': 5865187, 'read_bytes': 1121585, 'swap': 0, 'tx_bytes': 521, 'pss': 1582417, 'wchar': 9904, 'rchar': 360344, 'tx_packets': 2, 'rss': 3581421}}
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,779 | INFO     | queue_monitor       | pilot.user.atlas.utilities       | get_memory_monitor_info   | extracted standard info from prmon json
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,779 | INFO     | queue_monitor       | pilot.user.atlas.utilities       | get_memory_monitor_info   | extracted standard memory fields from prmon json
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,779 | INFO     | queue_monitor       | pilot.util.auxiliary.4002876565  | timing_report             | ..............................
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,779 | INFO     | queue_monitor       | pilot.util.auxiliary.4002876565  | timing_report             | . Timing measurements:
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,782 | INFO     | queue_monitor       | pilot.util.auxiliary.4002876565  | timing_report             | . get job = 0 s
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,782 | INFO     | queue_monitor       | pilot.util.auxiliary.4002876565  | timing_report             | . initial setup = 2 s
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,783 | INFO     | queue_monitor       | pilot.util.auxiliary.4002876565  | timing_report             | . payload setup = 0 s
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,783 | INFO     | queue_monitor       | pilot.util.auxiliary.4002876565  | timing_report             | . total setup = 2 s
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,783 | INFO     | queue_monitor       | pilot.util.auxiliary.4002876565  | timing_report             | . stage-in = 0 s
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,783 | INFO     | queue_monitor       | pilot.util.auxiliary.4002876565  | timing_report             | . payload execution = 3225 s
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,783 | INFO     | queue_monitor       | pilot.util.auxiliary.4002876565  | timing_report             | . stage-out = 4 s
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,783 | INFO     | queue_monitor       | pilot.util.auxiliary.4002876565  | timing_report             | ..............................
Do 12. Dez 16:38:03 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,784 | DEBUG    | queue_monitor       | pilot.control.job.4002876565     | send_state                | wrote heartbeat to file /root/Downloads/BOINC/slots/1/heartbeat.json
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,784 | DEBUG    | queue_monitor       | pilot.control.job                | queue_monitor             | job 4002876565 was dequeued from the monitored payloads queue
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,784 | DEBUG    | queue_monitor       | pilot.control.job                | queue_monitor             | tmp job object deleted
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,940 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | 
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,940 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | job summary report
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,940 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | --------------------------------------------------
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,940 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | PanDA job id: 4002876565
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,940 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | task id: 000649-3919225-21429
16:38:04 (32753): run_atlas exited; CPU time 4094.773100
16:38:04 (32753): called boinc_finish(0)
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,940 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | errors: (none)
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,940 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | status: LOG_TRANSFER = DONE 
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,941 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | pilot state: finished 
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,941 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | transexitcode: 0
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,941 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | exeerrorcode: 0
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,941 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | exeerrordiag: 
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,941 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | exitcode: 0
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,941 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | exitmsg: OK
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,941 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | cpuconsumptiontime: 4198 s
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,942 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | nevents: 10
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,942 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | neventsw: 0
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,942 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | pid: 8457
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,942 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | pgrp: 8457
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,942 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | corecount: 2
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,942 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | event service: False
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,942 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | --------------------------------------------------
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,942 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary.4002876565  | make_job_report           | 
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,943 | INFO     | retrieve            | pilot.control.job.4002876565     | has_job_completed         | job 4002876565 has completed
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,943 | INFO     | retrieve            | pilot.util.processes             | cleanup                   | overall cleanup function is called
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:00,956 | DEBUG    | retrieve            | pilot.util.processes             | cleanup                   | work directory was removed: /root/Downloads/BOINC/slots/1/PanDA_Pilot-4002876565
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:01,962 | INFO     | retrieve            | pilot.info.jobdata               | collect_zombies           | --- collectZombieJob: --- 10, [8457]
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:01,962 | INFO     | retrieve            | pilot.info.jobdata               | collect_zombies           | zombie collector trying to kill pid 8457
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:01,962 | INFO     | retrieve            | pilot.info.jobdata               | collect_zombies           | harmless exception when collecting zombies: [Errno 10] No child processes
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:02,968 | INFO     | retrieve            | pilot.util.processes             | cleanup                   | collected zombie processes
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:02,968 | INFO     | retrieve            | pilot.util.processes             | cleanup                   | will now attempt to kill all subprocesses of pid=8457
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:03,238 | INFO     | retrieve            | pilot.util.processes             | kill_processes            | process IDs to be killed: [8457] (in reverse order)
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:03,326 | WARNING  | retrieve            | pilot.util.processes             | kill_processes            | found no corresponding commands to process id(s)
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:03,326 | INFO     | retrieve            | pilot.util.processes             | kill_orphans              | Do not look for orphan processes in BOINC jobs
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:03,326 | INFO     | retrieve            | pilot.util.processes             | cleanup                   | resetting job object
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:03,326 | INFO     | retrieve            | pilot.control.job                | retrieve                  | ready for new job
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:03,326 | INFO     | retrieve            | root                             | retrieve                  | pilot has finished for previous job - re-establishing logging
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: mpi4py not found
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:03,344 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary             | pilot_version_banner      | ****************************************
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:03,344 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary             | pilot_version_banner      | ***  PanDA Pilot version 2.3.3 (16)  ***
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:03,345 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary             | pilot_version_banner      | ****************************************
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:03,345 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary             | pilot_version_banner      | 
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:03,345 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary             | pilot_version_banner      | pilot is running in a VM
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:03,345 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary             | display_architecture_info | architecture information:
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:03,776 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary             | display_architecture_info | 
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: LSB Version:	:core-4.1-amd64:core-4.1-noarch
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: Distributor ID:	CentOS
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: Description:	CentOS Linux release 7.6.1810 (Core) 
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: Release:	7.6.1810
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: Codename:	Core
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:03,777 | INFO     | retrieve            | pilot.util.auxiliary             | pilot_version_banner      | ****************************************
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:04,281 | DEBUG    | retrieve            | pilot.util.monitoring            | check_local_space         | checking local space on /root/Downloads/BOINC/slots/1
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:04,381 | INFO     | retrieve            | pilot.util.monitoring            | check_local_space         | sufficient remaining disk space (6945767424 B)
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:04,381 | WARNING  | retrieve            | pilot.control.job                | proceed_with_getjob       | since timefloor is set to 0, pilot was only allowed to run one job
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:04,381 | DEBUG    | retrieve            | pilot.control.job                | retrieve                  | [job] retrieve thread has finished
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:04,393 | WARNING  | copytool_out        | pilot.util.common                | should_abort              | data:copytool_out:received graceful stop - abort after this iteration
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:04,400 | WARNING  | monitor             | pilot.control.monitor            | control                   | aborting monitor loop since graceful_stop has been set
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:04,400 | INFO     | monitor             | pilot.control.monitor            | control                   | [monitor] control thread has ended
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:04,679 | DEBUG    | data                | pilot.control.data               | control                   | data control ending since graceful_stop has been set
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:04,679 | DEBUG    | data                | pilot.control.data               | control                   | [data] control thread has finished
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:04,830 | DEBUG    | copytool_in         | pilot.control.data               | copytool_in               | [data] copytool_in thread has finished
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:04,955 | INFO     | failed_post         | pilot.control.payload            | failed_post               | [payload] failed_post thread has finished
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:04,964 | INFO     | validate_post       | pilot.control.payload            | validate_post             | [payload] validate_post thread has finished
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:04,966 | INFO     | execute_payloads    | pilot.control.payload            | execute_payloads          | [payload] execute_payloads thread has finished
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:04,986 | DEBUG    | MainThread          | pilot.workflow.generic           | run                       | thread count now at 10 threads
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:04,986 | DEBUG    | MainThread          | pilot.workflow.generic           | run                       | enumerate: [<_MainThread(MainThread, started 139632831735616)>, <ExcThread(job, started 139632669579008)>, <ExcThread(validate_pre, started 139632247293696)>, <ExcThread(validate, started 139632661186304)>, <ExcThread(queue_monitoring, started 139632255686400)>, <ExcThread(payload, started 139632264079104)>, <ExcThread(copytool_out, started 139632272471808)>, <ExcThread(create_data_payload, started 139632644400896)>, <ExcThread(queue_monitor, started 139632619222784)>, <ExcThread(job_monitor, started 139632627615488)>]
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:05,419 | DEBUG    | copytool_out        | pilot.control.data               | copytool_out              | [data] copytool_out thread has finished
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:05,511 | DEBUG    | job                 | pilot.control.job                | control                   | job control ending since graceful_stop has been set
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:05,511 | DEBUG    | job                 | pilot.control.job                | control                   | [job] control thread has finished
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:05,587 | DEBUG    | payload             | pilot.control.payload            | control                   | payload control ending since graceful_stop has been set
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:05,587 | DEBUG    | payload             | pilot.control.payload            | control                   | [payload] control thread has finished
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:05,610 | DEBUG    | validate            | pilot.control.job                | validate                  | [job] validate thread has finished
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:05,617 | DEBUG    | create_data_payload | pilot.control.job                | create_data_payload       | [job] create_data_payload thread has finished
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:05,686 | INFO     | validate_pre        | pilot.control.payload            | validate_pre              | [payload] validate_pre thread has finished
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:05,850 | WARNING  | queue_monitor       | pilot.util.common                | should_abort              | job:queue_monitor:received graceful stop - abort after this iteration
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:05,851 | DEBUG    | queue_monitor       | pilot.control.job                | queue_monitor             | [job] queue monitor thread has finished
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:05,991 | DEBUG    | MainThread          | pilot.workflow.generic           | run                       | thread count now at 3 threads
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:05,991 | DEBUG    | MainThread          | pilot.workflow.generic           | run                       | enumerate: [<_MainThread(MainThread, started 139632831735616)>, <ExcThread(queue_monitoring, started 139632255686400)>, <ExcThread(job_monitor, started 139632627615488)>]
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:06,519 | WARNING  | queue_monitoring    | pilot.util.common                | should_abort              | data:queue_monitoring:received graceful stop - abort after this iteration
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:09,532 | DEBUG    | queue_monitoring    | pilot.control.data               | queue_monitoring          | [data] queue_monitor thread has finished
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:10,035 | DEBUG    | MainThread          | pilot.workflow.generic           | run                       | thread count now at 2 threads
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:10,040 | DEBUG    | MainThread          | pilot.workflow.generic           | run                       | enumerate: [<_MainThread(MainThread, started 139632831735616)>, <ExcThread(job_monitor, started 139632627615488)>]
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:49,488 | WARNING  | job_monitor         | pilot.control.job                | check_job_monitor_waiting_time | no jobs in monitored_payloads queue (waited for 72 s)
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:49,495 | DEBUG    | job_monitor         | pilot.control.job                | job_monitor               | [job] job monitor thread has finished
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:49,904 | INFO     | MainThread          | pilot.workflow.generic           | run                       | end of generic workflow (traces error code: 0)
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:49,904 | INFO     | MainThread          | root                             | wrap_up                   | traces error code: 0
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:49,904 | INFO     | MainThread          | root                             | wrap_up                   | pilot has finished
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:50 UTC [wrapper] ==== pilot stdout END ====
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:50 UTC [wrapper] ==== wrapper stdout RESUME ====
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:50 UTC [wrapper] Pilot exit status: 0
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:50 UTC [wrapper] STATUSCODE: 0
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:50 UTC [wrapper] apfmon messages muted
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: ---- find pandaID.out ----
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: total 60
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-rw-r--.  1 root root 11357 Jul 25 16:38 LICENSE
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-r--r--.  1 root root    20 Sep  9 13:04 MANIFEST.IN
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-r--r--.  1 root root     8 Dec  2 11:02 PILOTVERSION
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-r--r--.  1 root root  2212 Nov 14 11:01 README.md
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-rw-r--.  1 root root   221 Jul 25 16:38 TODO.md
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-------.  1 root root    11 Dec 12 15:42 pandaIDs.out
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: drwxrwxr-x. 14 root root   216 Dec 12 15:42 pilot
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rwxr-xr-x.  1 root root 20750 Dec  2 11:02 pilot.py
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-r--r--.  1 root root   766 Oct 10 16:01 setup.py
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-------. 1 root root 11 Dec 12 15:42 /root/Downloads/BOINC/slots/1/pilot2/pandaIDs.out
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 4002876565
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:50 UTC [wrapper] Test setup, not cleaning
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:50 UTC [wrapper] ==== wrapper stdout END ====
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:50 UTC [wrapper] ==== wrapper stderr END ====
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:50 UTC [wrapper] wrapper wrapperexiting ec=0, duration=3335
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: 2019-12-12 15:37:50 UTC [wrapper] apfmon messages muted
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019:  *** Error codes and diagnostics ***
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019:     "exeErrorCode": 0,
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019:     "exeErrorDiag": "",
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019:     "pilotErrorCode": 0,
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019:     "pilotErrorDiag": "",
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019:  *** Listing of results directory ***
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: insgesamt 379292
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root    266835 12. Dez 13:26 pilot2.tar.gz
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root      4492 12. Dez 13:46 queuedata.json
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rwx------. 1 root root     12641 12. Dez 13:49 runpilot2-wrapper.sh
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-------. 1 root root      2958 12. Dez 13:49 pandaJobData.out
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root       107 12. Dez 15:41 wrapper_26015_x86_64-pc-linux-gnu
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rwxr-xr-x. 1 root root      4813 12. Dez 15:41 run_atlas
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root       112 12. Dez 15:41 job.xml
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root      5719 12. Dez 15:41 init_data.xml
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: drwxrwx--x. 2 root root        86 12. Dez 15:41 shared
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root         0 12. Dez 15:41 boinc_lockfile
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root 365251149 12. Dez 15:41 EVNT.14296418._001447.pool.root.1
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root    275007 12. Dez 15:41 input.tar.gz
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root       815 12. Dez 15:41 RTE.tar.gz
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root      8581 12. Dez 15:41 start_atlas.sh
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: drwxr-xr-x. 3 root root        17 12. Dez 15:42 APPS
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-------. 1 root root   3742538 12. Dez 15:42 agis_schedconf.cvmfs.json
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-------. 1 root root   7755224 12. Dez 15:42 agis_ddmendpoints.json
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: drwxr-xr-x. 3 root root       229 12. Dez 15:42 pilot2
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root       535 12. Dez 16:23 boinc_task_state.xml
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-------. 1 root root   9192771 12. Dez 16:35 HITS.000649-3919225-21429._078090.pool.root.1
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-------. 1 root root       830 12. Dez 16:36 memory_monitor_summary.json
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-------. 1 root root    524718 12. Dez 16:36 log.000649-3919225-21429._078090.job.log.tgz.1
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-------. 1 root root     11713 12. Dez 16:37 heartbeat.json
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root      8192 12. Dez 16:37 boinc_mmap_file
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root        26 12. Dez 16:37 wrapper_checkpoint.txt
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-------. 1 root root      8015 12. Dez 16:37 pilotlog.txt
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-------. 1 root root    287451 12. Dez 16:37 log.000649-3919225-21429._078090.job.log.1
Do 12. Dez 16:38:04 CET 2019: -rw-------. 1 root root       491 12. Dez 16:37 c3mLDmx5czvnShfckohDCDFpABFKDmABFKDm7DvaDmABFKDmRrCowm.diag
Do 12. Dez 16:38:05 CET 2019: -rw-------. 1 root root       499 12. Dez 16:37 output.list
Do 12. Dez 16:38:05 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root       742 12. Dez 16:37 runtime_log
Do 12. Dez 16:38:05 CET 2019: -rw-------. 1 root root    839680 12. Dez 16:37 result.tar.gz
Do 12. Dez 16:38:05 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root      7759 12. Dez 16:37 runtime_log.err
Do 12. Dez 16:38:05 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root      2857 12. Dez 16:38 stderr.txt
Do 12. Dez 16:38:05 CET 2019: HITS file was successfully produced:
Do 12. Dez 16:38:05 CET 2019: -rw-------. 1 root root 9192771 12. Dez 16:35 shared/HITS.pool.root.1
Do 12. Dez 16:38:05 CET 2019:  *** Contents of shared directory: ***
Do 12. Dez 16:38:05 CET 2019: insgesamt 366780
Do 12. Dez 16:38:05 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root 365251149 12. Dez 15:41 ATLAS.root_0
Do 12. Dez 16:38:05 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root       815 12. Dez 15:41 RTE.tar.gz
Do 12. Dez 16:38:05 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root    275007 12. Dez 15:41 input.tar.gz
Do 12. Dez 16:38:05 CET 2019: -rw-r--r--. 1 root root      8553 12. Dez 15:41 start_atlas.sh
Do 12. Dez 16:38:05 CET 2019: -rw-------. 1 root root   9192771 12. Dez 16:35 HITS.pool.root.1
Do 12. Dez 16:38:05 CET 2019: -rw-------. 1 root root    839680 12. Dez 16:37 result.tar.gz

</stderr_txt>
]]>


©2024 CERN